Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms