Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms