Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TrabdQ99JY4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrabdQ99JY4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms