Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxp3Q99JB6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms