Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SptssbQ925E8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms