Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms