Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csmd1Q923L3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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