Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf3Q922U1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms