Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb6Q922F4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms