Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med28Q920D3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms