Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms