Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Grin3bQ91ZU9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grin3bQ91ZU9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms