Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atpaf2Q91YY4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms