Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC3

Acsl6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl6Q91WC3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl6Q91WC3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acsl6Q91WC3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acsl6Q91WC3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms