Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd3Q91WC0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms