Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usb1Q91W78 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms