Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn8Q91VA3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms