Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM1

Rnf130, E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf130Q8VEM1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf130Q8VEM1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms