Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg8Q8VE18 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms