Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Stx18Q8VDS8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Stx18Q8VDS8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx18Q8VDS8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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