Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med17Q8VCD5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms