Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nae1Q8VBW6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms