Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BbxQ8VBW5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms