Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slf1Q8R3P9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf1Q8R3P9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms