Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0J7

Vps37b, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37bQ8R0J7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps37bQ8R0J7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps37bQ8R0J7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms