Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms