Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Treml1Q8K558 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms