Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hecw1Q8K4P8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms