Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PolbQ8K409 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PolbQ8K409 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms