Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OptnQ8K3K8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms