Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MyripQ8K3I4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms