Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sash3Q8K352 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms