Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ssh3Q8K330 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ssh3Q8K330 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ssh3Q8K330 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ssh3Q8K330 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ssh3Q8K330 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ssh3Q8K330 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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