Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prpf39Q8K2Z2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms