Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y0

Rnf219, RING finger protein 219, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf219Q8K2Y0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rnf219Q8K2Y0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf219Q8K2Y0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf219Q8K2Y0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf219Q8K2Y0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf219Q8K2Y0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf219Q8K2Y0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf219Q8K2Y0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf219Q8K2Y0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf219Q8K2Y0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf219Q8K2Y0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms