Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd3Q8K2F0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms