Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs1Q8K212 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms