Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Polr1eQ8K202 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms