Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc47a1Q8K0H1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc47a1Q8K0H1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms