Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZS7

Hmgcll1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgcll1Q8JZS7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgcll1Q8JZS7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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