Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE4

Parp10, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp10Q8CIE4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp10Q8CIE4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms