Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Csnka2ipQ8CH19 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Csnka2ipQ8CH19 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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