Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

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Length 1,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rp1l1Q8CGM2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rp1l1Q8CGM2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rp1l1Q8CGM2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rp1l1Q8CGM2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rp1l1Q8CGM2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rp1l1Q8CGM2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rp1l1Q8CGM2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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