Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc73Q8CDM4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc73Q8CDM4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms