Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc87Q8CDL9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc87Q8CDL9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms