Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb2Q8CC27 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms