Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms