Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp9Q8CAS9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp9Q8CAS9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms