Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms