Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp20Q8C6M1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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